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151.
三种金属硫蛋白聚合物静电效应的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
考察了三种金属硫蛋白(大鼠金属硫蛋白亚型II,兔肝金属硫蛋白亚型I和兔肝金属硫蛋白亚型II)的单体、二聚体和三聚体在pH为5.6-8.5和10.6两种缓冲条件下的静电势分布。其中大鼠金属硫蛋白亚型II的结构直接来自于晶体数据,兔肝金属硫蛋白亚型I和II的结构则通过同源蛋白模型搭建。三种金属硫蛋白的静电势通过有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到。对于三种金属硫蛋白的二聚体,pH为5.6-8.5时,单体和单体之间的静电势分布具有明显的互补性;但pH≥10.6时,这种互补性会大大削弱。对于三种金属硫蛋白的三聚体,单体和二聚体之间主要表现为静电排斥,而且pH在10.6下的静电排斥力明显强于pH为5.6-8.5时的静电排斥。 相似文献
152.
三肽是蛋白质的基本组成模块, 具有重要生理功能. 解析其结构对于更大的肽及蛋白质研究具有重要意义. 基于二面角组合规则, 结合键旋转手段, 提出一种获取三肽构象系综的从头算量子化学方法. 使用该方法对八个目标三肽的势能面进行彻底搜索, 将所得结果与以前的预测方法及蛋白质数据库(PDB) 提取的结构进行比较.结果表明, 新方法搜索到了最完整的三肽构象系综. 此外证明了 PDB 结构存在缺陷, 遗漏了大部分中低能区的重要构象. 将新获取的三肽结构用于红外光谱研究, 理论结果与实验数据符合得更精准. 相似文献